MD Anderson Madrid cuenta con siete habitaciones con nivel de ltración HEPA con sobrepresión, 10 renovaciones a la hora y lámparas UV radiando el flujo de aire para evitar la proliferación de micro-organismos. Tres de las habitaciones están destinadas al trasplante de medula ósea y las otras cuatro son para casos de leucemia aguda, complicaciones que requieren el aislamiento del paciente.
El Servicio de Hematología está compuesto por hematólogos responsables del área clínica y de hematólogos especializados en el procedimiento de aféresis y criopreservación. MD Anderson Madrid cuenta con autorización para la realización de trasplante de méducla ósea autólogo y trasplante alogénico de donante familiar.